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Ambito IT o scientifico>Biologia
Nell’ambito dello studio delle malattie genetiche, il CASPUR collabora a ricerche sull’effetto di mutazioni puntiformi nella funzionalità di proteine di membrana e globulari. In particolare, il Consorzio ha realizzato iniziative di studio su alcune mutazioni del canale ionico Kir4.1 ritenute responsabili di alcune forme rare di autismo.
L’approccio combinato (sperimentale e computazionale) si sta dimostrando sempre più efficace sia nello studio dei virus noti, che nella ricerca in corso sui nuovi ceppi virali. Il ricorso al supercalcolo è divenuto ormai indispensabile sia per l'elaborazione della grande mole di dati prodotta dai sequenziatori di ultima generazione, che per lo studio delle proteine virali, interessanti per la progettazione di farmaci più efficaci e mirati.
Il CASPUR fornisce ai ricercatori del progetto bandiera "Epigenomica" una facility computazionale per l’analisi bioinformatica dei dati. L'enorme mole di dati derivanti dagli esperimenti condotti con le piattaforme di sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha reso necessario l’utilizzo di risorse computazionali disponibili esclusivamente in centri di supercalcolo.
Il CASPUR ha contribuito allo sviluppo di codici per l’analisi di spettri XANES che tengono conto delle fluttuazioni degli atomi (nell’intorno del metallo assorbitore) per produrre informazioni più dettagliate sulla loro struttura.