Sequenziamento genoma bufalino
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caspur.it
Il CASPUR partecipa attivamente, con risorse di calcolo e personale, al progetto per la ricostruzione completa del genoma del bufalo. Il CASPUR è, ormai da anni, impegnato in prima linea a supportare le ricerche in campo genetico; ha formato nel tempo un gruppo di lavoro altamente specializzato, con competenze di biostatistica e bioinformatica, che quotidianamente affianca i ricercatori genetisti.
La genomica è la disciplina scientifica che studia la struttura, la funzione e l’evoluzione degli acidi nucleici di una specie a livello globale. Questa scienza cerca di spiegare in che modo le modificazioni del genoma inducono aberrazioni nel normale funzionamento delle cellule.
Il Consorzio offre, alla sua utenza, un ambiente in cui i più diffusi codici modellistici sono installati e configurati per utilizzare al meglio le risorse di calcolo parallelo a disposizione. Inoltre, il CASPUR è all’avanguardia nella produzione di nuovo software per l’analisi via web di dati genetici prodotti da vari laboratori, ottenuti con microarray o sequenziatori di ultima generazione.
Una buona percentuale delle risorse di calcolo attualmente presenti al CASPUR sono dedicate all’analisi biomedica. All’interno del Consorzio, sono sviluppate e manutenute numerosissime banche dati contenenti sia i dati grezzi prodotti dagli esperimenti sia i risultati delle loro analisi.
Il CASPUR è membro del Consorzio Italiano del Bufalo che ha come obiettivo la ricostruzione dell’intero genoma del bufalo. A questa ricerca, promossa dal Parco Tecnologico Padano di Lodi con la supervisione dell’ANASB (Associazione Nazionale Allevatori della Specie Bufalina), partecipano diversi gruppi di ricerca italiani e stranieri appartenenti a USA, Brasile, Regno Unito, Irlanda, India, Egitto e Sud-Africa.